seamm_mbe

• seamm_mbe package
  • Submodules
  • seamm_mbe.algebra module
    • Correction
      • Correction.energy
      • Correction.forces
      • Correction.increments
      • Correction.max_increment_net_force
      • Correction.per_body
      • Correction.per_level
      • Correction.virial
    • FragmentResult
      • FragmentResult.energy
      • FragmentResult.forces
    • Increment
      • Increment.energy
      • Increment.forces
      • Increment.level
      • Increment.name
      • Increment.net_force
      • Increment.order
      • Increment.virial
    • MissingFragmentsError
    • increments()
    • mbe_correction()
    • missing_results()
  • seamm_mbe.assemble module
    • CellTerm
      • CellTerm.energy
      • CellTerm.forces
      • CellTerm.label
      • CellTerm.virial
    • Labels
      • Labels.breakdown
      • Labels.energy
      • Labels.forces
      • Labels.max_increment_net_force
      • Labels.molecular_pressure
      • Labels.net_force
      • Labels.per_body
      • Labels.per_level
      • Labels.pressure
      • Labels.reference_energy
      • Labels.stress
      • Labels.virial
    • assemble()
    • energy_offset()
    • intramolecular_virial()
  • seamm_mbe.catalog module
    • CATALOG
    • MoleculeType
      • MoleculeType.charge
      • MoleculeType.designated
      • MoleculeType.formula
      • MoleculeType.multiplicity
      • MoleculeType.name
      • MoleculeType.signature
    • define_type()
    • signature()
    • wl_labels()
  • seamm_mbe.elements module
    • IONIC_ELEMENTS
    • MONATOMIC
    • atomic_number()
    • hill_formula()
    • mass()
  • seamm_mbe.fragments module
    • Fragment
      • Fragment.atoms
      • Fragment.charge
      • Fragment.coordinates
      • Fragment.distances
      • Fragment.images
      • Fragment.in_sum
      • Fragment.key
      • Fragment.level
      • Fragment.max_distance
      • Fragment.molecules
      • Fragment.multiplicities
      • Fragment.multiplicity
      • Fragment.n_atoms
      • Fragment.name
      • Fragment.order
      • Fragment.slot_atoms
      • Fragment.subfragments
      • Fragment.symbols()
    • FragmentSet
      • FragmentSet.by_order()
      • FragmentSet.calculations()
      • FragmentSet.closure()
      • FragmentSet.counts()
      • FragmentSet.names
      • FragmentSet.selected()
    • canonical_key()
    • enumerate_fragments()
  • seamm_mbe.levels module
    • assign_levels()
  • seamm_mbe.selection module
    • CRITERIA
    • RULES
    • SelectionError
    • SelectionRules
      • SelectionRules.check()
      • SelectionRules.criterion
      • SelectionRules.cutoff()
      • SelectionRules.cutoffs
      • SelectionRules.max_order
      • SelectionRules.reach()
      • SelectionRules.rule()
      • SelectionRules.rules
  • seamm_mbe.system module
    • Molecule
      • Molecule.atoms
      • Molecule.coordinates
      • Molecule.designated
      • Molecule.index
      • Molecule.type
    • StructureError
    • System
      • System.formula()
      • System.from_configuration()
      • System.masses
      • System.minimum_image()
      • System.periodic
      • System.reference_point()
      • System.shift()
      • System.type_counts()
      • System.volume
      • System.widths
  • seamm_mbe.units module
    • EV_PER_A3_TO_ATM
    • EV_PER_A3_TO_GPA
    • EV_TO_KJ_PER_MOL
    • KBAR_TO_EV_PER_A3
    • as_tensor()
    • dftd4_virial_to_virial()
    • ev_to_kj_per_mol()
    • forces_to_gradients()
    • from_analyze_task()
    • gradients_to_forces()
    • kj_per_mol_to_ev()
    • pressure()
    • tensor_from_virial()
    • to_seamm()
    • vasp_stress_to_virial()
    • virial_from_tensor()
  • Module contents